Die pädagogische Arbeit im Haus Markus orientiert sich an der Individualität und Biographie des einzelnen Menschen. Im Rahmen eines ganzheitlichen, personenzentrierten Wohn- und Begleitkonzeptes werden Möglichkeiten der Selbstbestimmung und Teilhabe aktiv gefördert. Ziel ist es, die Kompetenzen des Einzelnen zu erweitern/zu erhalten und die Selbstverantwortung zu stärken. Ein wesentlicher Aspekt ist die Förderung der Integration in die Gemeinde Nottuln, d. h. die Nutzung und Mitgestaltung der Angebote in den kirchlichen und kommunalen Gemeinden zu fördern.